มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ มุ่งพัฒนาสู่ความเป็นเลิศทางวิชาการที่เป็นที่ยอมรับในระดับสากลโดยกำหนดเป้าหมายที่จะนำมหาวิทยาลัยไปสู่มหาวิทยาลัยที่เน้นการวิจัย (RESEARCH UNIVERSITY) และก้าวสู่การเป็นมหาวิทยาลัยชั้นนำในระดับโลกในอนาคต จึงได้วางนโยบายส่งเสริม สนับสนุนให้หน่วยงานต่างๆ พัฒนาสาขาวิชาการที่มีความเข้มแข็งสู่ความเป็นเลิศเฉพาะทาง และสนับสนุนการรวมกลุ่มบุคลากรที่มีความรู้และทักษะในสาขาวิชาการที่สนใจร่วมกัน ให้สามารถผนึกกำลังสร้างทีมวิจัย เครือข่ายการวิจัย หรือกลุ่มนักวิชาการที่เข้มแข็งจากหลายหน่วยงานร่วมกันเพื่อพัฒนาไปสู่การเป็นศูนย์ความเป็นเลิศทางวิชาการ (CENTER OF EXCELLENCE) และได้รับอนุมัติจากมหาวิทยาลัยให้จัดตั้งศูนย์ประสานเพื่อการพัฒนาสู่ความเป็นเลิศ ขึ้นอย่างเป็นทางการ เมื่อวันที่ 15 สิงหาคม พ.ศ. 2551 เพื่อเป็นหน่วยงานกลางที่ทำหน้าที่ประสานงานและบริหารงานทางธุรการ ให้ศูนย์ความเป็นเลิศทางวิชาการด้านต่างๆ ที่อยู่ภายใต้การกำกับดูแลของศูนย์ประสานเพื่อการพัฒนาสู่ความเป็นเลิศ