ศูนย์ย่อยตามประเภทกลุ่มงานวิจัย 5 กลุ่มโครงการ

1. โครงการวิจัยการจัดการทรัพยากรชีวภาพและการบริการของระบบนิเวศทางบก
     - สำรวจความหลากหลายทางชีวภาพทั้งบนบก ชายฝั่ง และทางทะเล ทั้งด้านสถานภาพ (status) ค้นหาชนิดใหม่ (new species) และพันธุกรรมใหม่
     - รวบรวมฐานข้อมูลเพื่อการอนุรักษ์ การฟื้นฟู และการใช้ประโยชน์ในด้านต่างๆ ทั้งที่อยู่อาศัย เครื่องนุ่งห่ม ยารักษาโรค อาหาร และศึกษาถึง การ. เปลี่ยนแปลง และพลวัตของระบบนิเวศตามการเปลี่ยนแปลงของภูมิอากาศโลกในปัจจุบันภายใต้สภาวะโลกร้อน (global warming) 
     - ค้นหาทรัพยากรที่มีศักยภาพในการใช้ประโยชน์ ที่สามารถรองรับ ความต้องการของสังคมประเทศไทยและสังคมผู้สูงวัยโลก ในการเป็นแหล่งผลิตปัจจัยสี่ และคุณภาพชีวิต 
     - เน้นศึกษาในพื้นที่ที่มหาวิทยาลัยมีการดำเนินงานวิจัยในระยะยาว ได้แก่ สถานีวิจัยดอยปุย จังหวัดเชียงใหม่ สถานีวิจัยสิ่งแวดล้อมสะแกราช จังหวัดนครราชสีมา สถานีวิจัยลุ่มน้ำแม่กลอง จังหวัดกาญจนบุรี และสถานีวิจัยเพื่อการพัฒนาชายฝั่งอันดามัน จังหวัดระนอง เป็นต้น

2. โครงการวิจัยการจัดการทรัพยากรชีวภาพและการบริการของระบบนิเวศทางน้ำ
      - ศึกษาการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศจากการเพิ่มขึ้นของก๊าซเรือนกระจกในบรรยากาศและผลกระทบที่เกิดขึ้นเป็นปัญหาที่ส่งผลกระทบต่อมนุษยชาติเป็นวงกว้างทั้งทางตรงและทางอ้อม
     - ศึกษาความหลากหลายของทรัพยากรชีวภาพชายฝั่ง โดยเฉพาะในระบบนิเวศป่าชายเลนและป่า ชายหาด และความหลากหลายของทรัพยากรชีวภาพทางทะเล เช่น ปะการัง หญ้าทะเล ฯลฯ
     - ศึกษาระบบนิเวศชายฝั่งและทางทะเล โดยเน้นการศึกษาการเปลี่ยนแปลงในระยะยาว
     - ศึกษาศักยภาพของระบบนิเวศชายฝั่งและทางทะเลต่อการเป็นแหล่งอนุบาลสัตว์น้ำ การบรรเทาความรุนแรงของภัยพิบัติและการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ
     - ศึกษาทรัพยากรชีวภาพทางทะเลและชายฝั่งมาใช้ประโยชน์อย่างยั่งยืน เช่น การเป็นแหล่งอาหาร ไม้เพื่อใช้ประโยชน์และพลังงาน และการท่องเที่ยว เป็นต้น

3. โครงการวิจัยการอนุรักษ์ทรัพยากรธรรมชาติ : ผลกระทบและการปรับตัวของทรัพยากร ธรรมชาติต่อการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ 
     - ศึกษาการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศจากการเพิ่มขึ้นของก๊าซเรือนกระจกในบรรยากาศและผลกระทบที่เกิดขึ้นเป็นปัญหาที่ส่งผลกระทบต่อมนุษยชาติเป็นวงกว้างทั้งทางตรงและทางอ้อม
     - การพัฒนาเทคนิคในการติดตามตรวจสอบศักยภาพในการกักเก็บ/ปลดปล่อยก๊าซเรือนกระจกของระบบนิเวศต่างๆ
     - ผลกระทบจากการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศที่มีความหลากหลายทางชีวภาพและระบบนิเวศต่างๆ ทั้งบนบก และทางน้ำ โดยเฉพาะระบบนิเวศที่อ่อนไหว และ/หรือ ชนิดพืช/สัตว์ ที่เสี่ยงต่อการสูญพันธุ์
     - ผลกระทบจากการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศต่อศักยภาพและการจัดการการท่องเที่ยวเชิงนิเวศ
     - การจัดการผลกระทบจากการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ และ/หรือ ภัยพิบัติธรรมชาติ
     - การสร้างความสามารถในการปรับตัวของระบบนิเวศและความหลากหลายทางชีวภาพ เช่น การศึกษาวิจัยเพื่อการอนุรักษ์ชนิดพืช/สัตว์ ที่เสี่ยงต่อการสูญพันธุ์ การปรับปรุงพันธุ์พืช/สัตว์ ที่ปรับตัวได้ดีต่อการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ
     - การอนุรักษ์และการใช้ประโยชน์ทรัพยากรธรรมชาติอย่างยั่งยืน
     - การจัดการลุ่มน้ำและการใช้ประโยชน์ที่ดินอย่างยั่งยืน
     - ทรัพยากรธรณีและปฐพีเพื่อการใช้ประโยชน์ทางอุตสาหกรรม
     - การจัดการพิบัติภัยธรรมชาติ

4. โครงการวิจัยเทคโนโลยีการใช้ประโยชน์จุลินทรีย์
     - การวิจัยทางด้านเทคโนโลยีการหมัก โดยวิจัยและประยุกต์ใช้เทคโนโลยีจากเซลล์สิ่งมีชีวิต ทั้งจากจุลินทรีย์ พืช และสัตว์ เพื่อผลิตผลิตภัณฑ์ ต่างๆที่มีมูลค่าเพิ่ม เช่น สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เอนไซม์ กรดอินทรีย์ เป็นต้น 
     - พัฒนานวัตกรรมของกระบวนการหมัก ในการเพิ่มประสิทธิภาพการหมัก โดย การค้นหาและปรับปรุงสายพันธุ์จุลินทรีย์ที่เหมาะสมกับกระบวนการผลิต การใช้เทคนิคการหมักแบบต่างๆ เช่น แบบครั้งคราว และแบบต่อเนื่อง รวมถึงการพัฒนาและประยุกต์การหมัก เช่น การหมักแบบ two-stages การหมัก recycle ทั้งนี้เพื่อให้กระบวนการหมักมีประสิทธิภาพสูงสุด และมีการประยุกต์เทคนิค ทางด้านการเลียนแบบกระบวนการ การสร้างแบบจำลองการหมัก และการประยุกต์ใช้คอมพิวเตอร์ในการควบคุม มาใช้ในกระบวนการ 
     - พัฒนากระบวนการผลิตยังต้องมีความเชื่อมโยงกับอุตสาหกรรม ทั้งทางตรง หรือผ่านทางกองทุนสนับสนุนการวิจัย เพื่อนำเอาผลได้ไปใช้ในอุตสาหกรรม เช่น การพัฒนากระบวนการผลิตไซลิทอล การพัฒนากระบวนการผลิตกลูโคแมนแนนจากเซลล์พืช การพัฒนากระบวนการผลิตฟรุกโทและอินูโลโอลิโก แซ็กคาไรด์ การพัฒนากระบวนการผลิตกรดแลกติก การพัฒนากระบวนการผลิตสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพจากเซลล์ขมิ้นชัน โดยกระบวนการหมักจะอาศัยสารตั้งต้นจากวัตถุดิบทางการเกษตร เช่น แก่นตะวัน บุก อ้อย ขมิ้นชัน  เป็นต้น
     - พัฒนากระบวนการเพื่อสร้างพลังงานชีวภาพ หรือเอทานอล จากวัตถุดิบเหลือใช้ทางการเกษตร เช่น ทะลายปาล์ม เป็นต้น และการตระหนักถึงความสำคัญของสิ่งแวดล้อมภายใต้บริบทของการพัฒนาทางอุตสาหกรรมเกษตร

5. โครงการวิจัยการจัดการและการใช้ประโยชน์พืชและสัตว์
     - การพัฒนาคนให้มีคุณภาพและมีคุณธรรม โดยเน้นดุลยภาพของทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม  
     - การใช้จุดแข็งของความหลากหลายทางชีวภาพ ในการพัฒนาปัจจัยสนับสนุนทางด้านเศรษฐกิจ
     - การดำรงความหลากหลายทางชีวภาพ และสร้างความมั่นคงของฐานทรัพยากรธรรมชาติ และคุณภาพสิ่งแวดล้อม สร้างความสมดุล ระหว่างการอนุรักษ์และการใช้ประโยชน์อย่างยั่งยืน และมีการสร้างสรรค์คุณค่า 
     - สนับสนุนให้ชุมชนมีองค์ความรู้และสร้างภูมิคุ้มกันเพื่อคุ้มครองฐานทรัพยากร คุ้มครองสิทธิ์ และส่งเสริมบทบาทของชุมชนในการบริหารจัดการทรัพยากร ปรับแผนการผลิตที่เป็นมิตรกับสิ่งแวดล้อม 
     - ศึกษาการใช้ประโยชน์ทรัพยากรชีวภาพ การปลูก/เพาะเลี้ยง (domestication)เทคโนโลยีการปรับปรุงพันธุ์พืชและสัตว์ (breeding technology) การฟื้นฟูระบบนิเวศ (ecological restoration) ระบบวนเกษตร (agroforestry system) 
     - การจัดการอย่างมีส่วนร่วมเชิงบูรณาการ (participatory integrated management) การนำไม้ (wood) และไม่ใช่ไม้ (non-wood) มาใช้ประโยชน์โดยใช้เทคโนโลยีเชิงกล (mechanical technology)    เช่น  การผลิตผลิตภัณฑ์ไม้ชนิดต่างๆ ทั้งการนำมาใช้ในการก่อสร้าง บรรจุภัณฑ์ เฟอร์นิเจอร์ และเทคโนโลยีเชิงเคมี (chemical technology) เช่นการผลิตเยื่อกระดาษ   เรยอน เคมีภัณฑ์ (bio-chemicals) ตลอดจนเชื้อเพลิงชีวภาพ (bio-fuels) อันได้แก่ ฟืน ถ่าน และเชื้อเพลิงเหลว เป็นต้น
     - ส่งเสริมการนำผลงานวิจัยในประยุกต์ใช้ประโยชน์เชิงวิชาการ เชิงนโยบายและเชิงพาณิชย์ โดยที่มีการสร้างงาน สร้างรายได้ และมีการเจริญเติบโตของเศรษฐกิจ  ที่มีความยั่งยืน บนพื้นฐานของทรัพยากรชีวภาพ (bio-based or green economy) และเน้นการใช้ประโยชน์ในระดับชุมชนอย่างยั่งยืน